Como no das más datos sobre $f$, te diré lo que se me ocurre, en general. Si tienes explícitamente a $f$, entonces hay dos posibilidades: Que tengas idea o no sobre la multiplicidad $m$ de la raíz que estás buscando. En el primer caso, lo que debes hacer es no aplicar el método de Newton directamente a $f$, sino a su $m-1$ derivada. Para la función que te queda, la raíz que estás buscando sólo tiene multiplicidad 1, y desaparece el problema que mencionas. Ahora, si no tienes idea sobre el valor de $m$, lo que te recomendaría es que vayas corriendo el método de Newton primero para $f$, luego para $f'$, $f''$, etc., hasta que desaparezcan tus problemas de convergencia, osea, cuando la multiplicidad de la raíz ya no sea mayor que uno.
Por otro lado, si no tienes explícitamente a $f$, la recomendación sería básicamente la misma, sólo que tendrías que aproximar la derivada usando diferencias finitas.