Algunas pequeñas aportaciones. Si tomas un conjunto $M$ de cardinalidad $n$ y tomas un elemento $e\in M$ puedes definir la operación dada por $ae=ea=a$ para toda $a\in M$ y $ab=e$ siempre que $a,b\neq e$. Este magma tendrá a $e$ como único nilpotente y todos sus subgrupos serán de la forma $\{e,a\}$ (al tener dos elementos $a,b$ distintos de $e$ se tendría que $a^2 b=eb=b$ y $a(ab)=ae=a$, por lo que no sería asociativo). Por lo tanto $M$ tendría $n-1$ subgrupos independientes. ¿Será éste el máximo?
Sea $(M,\cdot)$ un magma único idempotente $e$ con $k$ subgrupos independientes dos a dos. Sea $N$ la unión de los subgrupos de $M$. Definamos $a*b=ab$ si $a,b\in N$, $a*e=e*a=a$ si $a\in M\setminus N$ y $a*b=e$ si $a,b\in M\setminus N$ y $a\neq b$. $(M,*)$ tiene entonces $k+|M|-|N|$ subgrupos independientes, por lo que si $k$ es máximo se tiene que tener $M=N$, es decir, todo elemento está en algún subgrupo.